Rémi Chappaz Docteur es Sciences Professeur - Aix-Marseille Université IMBE - CNRS UMR 6372 - INEE		Facultés des Sciences St Charles Case 36 3, Place Victor Hugo 13331 Marseille cedex 032 Email: remi.chappaz@univ-provence.fr Téléphone: 04 13 55 07 52 / 04 13 55 00 48
Département : Paléoenvironnements et biogégraphie évolutive Equipe : EVOLUTION, GENOME, ENVIRONNEMENT
Expertise : Ecologie, Hydrobiologie, Ichtyologie.
Thèmes de recherche, mots clé : Ichtyologie, Biologie de la Conservation, Ecologie des rspèces invasives et conséquences, Phylographie et phylogéographie.
Enseignement : Responsable de la spécialité de Master " Médiation en Environnement " au sein du Master SET. Directions ou co-directions de thèse				Tâches administratives: Directeur de composante Département Environnement Technologies & Société Case 75, 3 Place Victor Hugo 13331 Marseille Cedex 03. DENTES et invité permanent du Conseil Scientifique, du CEVU et du Conseil d'administration de l'Université.
- Membre du comité scientifique de la Maison Régionale de l'Eau (Barjols - Var) depuis 1993, - Association pour la promotion de l'éducation à l'Environnement - Membre du Conseil Scientifique Régional du Patrimoine naturel (CSRPN) PACA, depuis 1998 (nommé par le Ministre du MEDD après avis du Préfet de Région). - Membre du Conseil Scientifique du Parc Naturel Régional du Queyras (depuis 2000), - Membre du Conseil Scientifique du GIP Réhabilitation de l'Etang de Berre (GIPREB) entre 2000 et 2007 - Expert près la Cours d'Appel d'Aix en Provence depuis 1988 en Ecologie Environnement et Pollutions. - Membre du CS du Conservatoire des Ecosystèmes Provençaux. CEEP (Association 1901 de Protection de la Nature reconnue d'utilité publique). - Expert près la Direction Régionale à la Recherche et à la Technologie depuis début 2005. - Membre du CESEB, Comité d'expert pour le suivit de l'Etang de Berre, il s'agit d'un comité d'experts internationaux mise en place par le MEDD suite à la condamnation de la France par la Cour de Justice Européenne. (nommé par le Ministre du MEDD). - Membre du Comité interdépartementale de Gestion des lacs et retenues du Verdon. Nomination depuis 1989 par le Préfet de Région. - Rapporteur pour le MEDD pour trois sites NATURA 2000. Le site Buech (FR 9301519), les deux sites Durance (FR 9301589 et FR 9312003). - Membre du Conseil Scientifique du LIFE II Aprons. - Membre du CS du Syndicat Mixte d'aménagement de la Vallée de la Durance. - Membre pendant huit ans du Conseil Scientifique de l'Université Aix Marseille I
Publications récentes: 2010 : M. Durbec, B. Nguyen Thé Fontez, J. Grey, C. Harrod, N. Stolzenberg, R. Chappaz and L. Cavalli. 2010. Biological influences on inter and intraspecific isotopic variability among paired chondrostomes fishes. C.R. Biologies. Doi 10.1016/j.crvi 2010 Vincent Dubut & Rémi Grenier & Emese Meglécz & Rémi Chappaz & Caroline Costedoat & Delphine Danancher & Stéphane Descloux & Thibaut Malausa & Jean-François Martin & Nicolas Pech & André Gilles. 2010. Isolation and characterization of 55 novel polymorphic microsatellite loci for the critically endangered Zingel asper L. (Actinopterygii: Perciformes: Percidae). European Journal of Wildlife Research DOI 10.1007/s10344-010-0421-x Dubut Vincent, M. Sinama, J-F. Martin, E. Meglecz, J. Fernandez, R. Chappaz, A. Gilles and C. Costedoat. Cross-species amplification of 41 microsatellites in European cyprinids: A tool for evolutionary, population genetics and hybridization studies. BMC Research Notes. 2010, 3:135 Corse E., Costedoat C., Chappaz R., Pech N., Martin J.-F. & Gilles A., 2010. PCR-based method for diet analysis in freshwater organisms using 18S rDNA barcoding on faeces. Molecular Ecology Resources, 10, 96-108. Gilles A., C. Costedoat, B. Barascud, A. Voisin, P. Banarescu, P.G. Bianco, P.S. Economidis, D. Maric, & R. Chappaz. 2010. Speciation pattern of Telestes souffia complex (Teleostei, Cyprinidae) in Europe using morphological and molecular markers. Zoologica Scripta, 39 : 225-242. Cavalli L., Knight C.M., Durbec M., Chappaz R. & Gozlan R.E., 2009. 24 h in the life on a apron Zingel asper. Journal of Fish Biology, 75 : 723-727 Durbec M, L. Cavalli, J. Grey, R. Chappaz et B. Nguyen The. 2009. The use of stable isotopes to trace small-scale movements by small fish species. Hydrobiologia 641:23-31. Dubut V., Martin J.-F., Gilles, A., Van Houdt J., Chappaz R. & Costedoat C., 2009. Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci for the dace complex: Leuciscus leuciscus (Teleostei: Cyprinidae). Molecular Ecology Resources, 9, 1179-1183. Corse E., Caroline Costedoat, Nicolas Pech, Remi Chappaz, Jonathan Grey and Andre Gilles. Trade-off between morphological convergence and opportunistic diet behavior in fish hybrid zone. Frontiers in Zoology 2009. doi: 10.1186/1742-9994-6-26 Dubut, V., Martin J.-F., Costedoat C., Chappaz R. & Gilles A., 2009. Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci in the freshwater fishes Telestes souffia and T. muticellus (Teleostei: Cyprinidae). Molecular Ecology Resources, 9, 1001-1005. 2005 à 2009 Cavalli L., Knight C.M., Durbec M., Chappaz R. & Gozlan R.E., 2009. 24 h in the life on a apron Zingel asper. Journal of Fish Biology, 74 : Corse E., Costedoat C., Chappaz R., Pech N., Martin J.-F. & Gilles A., 2009. PCR-based method for diet analysis in freshwater organisms using 18S rDNA barcoding on faeces. Molecular Ecology Resources, sous presse. Dubut V., Martin J.-F., Gilles, A., Van Houdt J., Chappaz R. & Costedoat C., 2009. Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci for the dace complex: Leuciscus leuciscus (Teleostei: Cyprinidae). Molecular Ecology Resources, sous presse. Dubut, V., Martin J.-F., Costedoat C., Chappaz R. & Gilles A., 2009. Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci in the freshwater fishes Telestes souffia and T. muticellus (Teleostei: Cyprinidae). Molecular Ecology Resources, sous presse. Corse E., Caroline Costedoat, Nicolas Pech, Remi Chappaz, Jonathan Grey and Andre Gilles. 2009. Trade-off between morphological convergence and opportunistic diet behavior in fish hybrid zone. Frontiers in Zoology sous presse Gilles A., C. Costedoat, B. Barascud, A. Voisin, P. Banarescu, P.G. Bianco, P.S. Economidis, D. Maric, & R. Chappaz. 2009. Speciation pattern of Telestes souffia complex (Teleostei, Cyprinidae) in Europe using morphological and molecular markers. Zoologica Scripta, sous presse. Costedoat C., Pech N., Chappaz R., & A. Gilles, (2007). Novelties in hybrid zones: crossroads between population genomic and ecological approaches. Plos One 2(4) e257. Costedoat C., R. Chappaz, B. Barascud, O. Guillard, A. Gilles, Heterogenous colonization pattern of European Cyprinids as highlighted by the dace complex. Mol. Phyl and Evolution. 41. (2006) 127-148. Costedoat C., N. Pech, Salducci M-D., R. Chappaz & A. Gilles. Evolution of mosaic hybrid zone between invasive and endemic species of Chondrostoma through space and time. Biol. J. Linn. Society 85 (2): 135-155 JUN 2005
Activités Les thèmes de recherche couvrent les domaines de l'écologie des eaux et de la biologie de la conservation. Mes activités de recherche se concentrent sur plusieurs axes principaux : 1 - Ecologie des populations de poissons en lacs de haute altitude et lacs de retenus : évolutions anthropiques de ces milieux, (trophiques, réchauffement, introductions d'espèces), conséquences sur leur gestion et relations pêcheurs- protection en collaboration avec les Parcs des Ecrins et du Queyras et l'Office de l'Eau et des Milieux Aquatiques et de nombreuses Fédérations Départementales de pêches dont je suis conseiller. Publication majeure: Journal of Fish Biology 2002, Programme INTERREG 2006. Il s'agit de programmes pluridisciplinaires qui intègrent des spécialistes de plusieurs niveaux trophiques afin de comprendre les relations fonctionnelles au sein des écosystèmes aquatiques limniques. Je dirige actuellement un programme sur le lac de Serre Ponçon (Htes Alpes) programme conduit avec J-L Boudenne, (UMR CNRS LCP), A. Cazaubon, C. Cuoc (UMR CNRS 6116 IMEP). 2 - Etude de la fragmentation de l'habitat dans une rivière particulièrement aménagée, la Durance ; conséquences génétiques et écologiques. Etude des traits d'histoire de vie des espèces ichtyologiques et conséquences pour la gestion physique du milieu, (débits réservés, seuils, barrages, extractions) dans le bassin de la Durance. Propositions aux gestionnaires et usagers du cours d'eau. Cette partie conduit à une modélisation et à la validation du modèle 5M7 élaboré par le CEMAGREF. Ce modèle devrait autoriser la généralisation de son usage, notamment lors des études à large échelle prévues sur la Durance et bien d'autres cours d'eaux. Cet outil a pour vocation d'accroître les connaissances sur l'écologie des poissons, notamment quant à leur occupation journalière ou saisonnière de l'espace aquatique disponible dans une rivière sous fortes contraintes anthropiques (thèse de R Rifflard). Ce modèle devrait être utilisé dans l'évaluation des débits réservés biologiques lors des renouvellements de concessions hydroélectriques. Cet aspect de mon travail me conduit à l'étude d'espèces endémiques notamment l'Zingel asper. Les populations de la Durance représentent près de 90% de l'effectif mondial de l'espèce. Ces travaux se font en collaboration avec un syndicat mixte de gestion de rivière (78 communes), EDF, l'ONEMA, l'Agence de l'Eau et le LIFE Apron II. Publication majeure : Journal of Fish Biology 2003 et 2009 Une étude de génétique des populations d'aprons est bien avancée sur la Durance et 60 microsatellites ont été mis au point dans le cadre de ce programme. il s'agit de mesurer les possibilités d'échanges entre différentes populations séparées par des barrages. Cette étude bénéficie d'un financement Electricité de France et du Parc Naturel Régional du Verdon, l'aspect technique est porté par le Dr. V. Dubut. Cet aspect de mon travail se conduit également avec Electricité de France (Bourse CIFRE Martiel Durbec, 2009), à une étude pluridisciplinaire sur les conséquences prédictives de l'augmentation du débit réservé en Durance au droit de l'ouvrage de Ste Tulle. Plusieurs aspects sont abordées à travers deux espèces (pisces), le T. soufia (Convention de Bern et liste habitat-faune flore) et A. bipunctatus : la répartition saisonnière au sein du mésohabitat, croissance, alimentation (contenus stomacaux et isotopes stables C et N), reproduction. Une des mes activités importantes de recherches porte sur les caractéristiques et conséquences de la colonisation du bassin du Rhône par une espèce de poisson invasive sur une espèce endémique : Le hotu (Chondrostoma nasus), invasif et l'espèce indigène, le toxostome (Ch. toxostoma). L'approche moléculaire permet de distinguer les individus appartenant aux différents groupes (espèces pures ou hybrides entre les deux espèces en distinguant le niveau d'hybridation), c'est la thèse de C. Costedoat soutenue en novembre 2005. La comparaison des caractéristiques écologiques des différents groupes (thèse N. Stolzenberg soutenue en novembre 2006) permet de préciser les mécanismes d'hybridation et les conséquences de l'introduction sur les différentes populations. Outre l'étude même du mécanisme d'introgression sous la pression anthopique du milieu, il s'agit d'élaborer, aussi, des mesures de gestion pour éviter la colonisation d'autres bassins versants. La compétition pour l'espace entre les deux espèces doit conduire à une compétition alimentaire. C'est la raison pour laquelle, nous avons lancé un sujet de thèse sur le " code barre " alimentaire de ces deux espèces et de leurs nombreux hybrides. (Thèse E. Corse 2009 et M. Simana 2012). Publication majeure : Plos ONE 2007, Frontiers in Zoology 2009 3 - Systématique et phylogéographie d'espèces patrimoniales , au niveau Européen : le Blageon Telestes soufia, la Vandoise, Leuciscus leuciscus, les deux Chondrostomes et l'Apron. Approches morphologiques, écologiques et moléculaires et conséquences sur les statuts de protection. Nous avons utilisé des approches morphologies, allozymiques et l'ADN mitochondrial pour discerner les populations de Cyprinidés de différents bassins versant, nous reprenons le jeu de données en développant une approche par les microsatellites pour les quatre espèces. Une publication est en préparation sur les microsatellites de l'apron, dans un premier temps, l'application de ces microsatellites à notre jeu de données français va donner lieu à une nouvelle publication. Publication majeure: Mol Phyl Evol. 2006, Molecular Ecology Resources 2009, a et b.
Colloques: Congrès de l'Association Française de Limnologie et de l'Association des Océanographes de France. Lyon ENTPE 04-07 juillet 2005 (une communication avec C. Costedoat et A . Gilles) Congrès " Le réveil du Dodo " Conservation et Biodiversité. Mars 2006 (1 communication) Paris. (une communication avec C. Costedoat et A . Gilles) International Meeting "Genetic of Speciation", Vancouver July 2006. C. Costedoat, N. Pech, R. Chappaz & A. Gilles. Poster: Chondrostoma hybrid zone: interaction between genes and environment Fisheries Society of the British Isles Annual Symposium University of Exeter, 23 - 27 July 2007 " Symposium on Non-Native Fishes: Integrated Biology of Establishment Success and Dispersal ".http://www.fsbi.org.uk/2007/index.html Présentation orale : Ecological interaction between invasive Chondrostoma nasus, native Chondrostoma toxostoma and hybrids. (Durbec M., Cavalli L., Nguyen the B., Stolzenberg N., Chappaz R.) Poster : "Long term study on the consequences of a fish introduction on an endemic species. Ecological characteristics of hybrids and parent species" (Cavalli L., Stolzenberg N. & Chappaz R.) European congres of Ichthyology ECI XII -Cavtat (Dubrovnik), 9-13 of September 2007. Présentation orale : " Crossroads between population genomic and ecological approaches in the study of hybrid zone" Costedoat C., Pech N., Chappaz R. & Gilles A.