Nicolas Pech Docteur en Sciences Maître de conférences IMBE - CNRS UMR 7263 - INEE Sa page perso		Facultés des Sciences St Charles 3, Place Victor Hugo 13331 MARSEILLE CEDEX 03 13331 Marseille cedex 03 Email: nicolas.pech@univ-provence.fr Téléphone: 04 13 55 07 73
Département : Paléoenvironnements et biogégraphie évolutive Equipe : EVOLUTION, GENOME, ENVIRONNEMENT
Expertise : Statistique
Thèmes de recherche, mots clé : Modélisation statistique des relations génome-environnement / sélection de modèles / statistique multivariée / morphométrie / phylogéographie / génomique / analyse des données NGS
Enseignement : L1 STE: Mathématiques appliquées L3 STE/BEE: Probabilités et statistique (responsable) L3 STE/BEE : Biostatistique (responsable) / Génomique des populations M1 MASS : Classification supervisée et non supervisée (co-responsable) M1 MASS Méthodes de validation et de discrimination (responsable) M1 BBSG : Phylogénie M2 BBSG : Génomique des populations				Tâches administratives: Membre du comité d’organisation des 42èmes journées de statistique (Marseille, 25-28 mai 2010)
Publications récentes: 2011 T. Malausa, A. Gilles, E. Meglécz, H. Blanquart, S. Duthoy, C. Costedoat, V. Dubut, N. Pech, P. Castagnone-Sereno, C. Délye, N. Feau, P. Frey, P. Gauthier, T. Guillemaud, L. Hazard, V. Le Corre, B. Lung-Escarmant, P-J G. Malé, S. Ferreira & J-F Martin. High-throughput microsatellite isolation through 454 GS-FLX Titanium pyrosequencing of enriched DNA libraries. Molecular Ecology Resources, in press. M. Sinama, V. Dubut, C. Costedoat, A. Gilles, M. Junker, Thibaut Malausa, J-F Martin, G. Neve, N. Pech, T. Schmitt, M. Zimmerman & E. Meglecz. Challenge for microsatellite development in Lepidoptera: Euphydryas aurinia Rottemburg, 1775 (Nymphalidae) as a case study. European journal of entomology sous presse. E.Meglécz, S. Piry, E. Desmarais, M. Galan, A. Gilles, E. Guivier, N. Pech & Jean-François Martin. SESAME (SEquence Sorter & AMplicon Explorer): Genotyping based on high-throughput multiplex amplicon sequencing Bioinformatics first published online November 16, 2010 doi:10.1093/bioinformatics/btq641. 2010 V. Dubut, R. Grenier, E. Meglécz, R. Chappaz, C. Costedoat, D. Danancher, S. Descloux, T. Malausa, J-F Martin, N. Pech & André Gilles. 2010. Isolation and characterization of 55 novel polymorphic microsatellite loci for the critically endangered Zingel asper L. (Actinopterygii: Perciformes: Percidae). European Journal of Wildlife Research, 56(6), 931-938. J-F. Martin, N. Pech, E. Meglécz , S. Ferreira, C. Costedoat, V. Dubut, T. Malausa & Gilles A. 2010. Representativeness of microsatellites distribution in genomes as revealed by 454 GS-FLX Titanium pyrosequencing, BMC Genomics. 11:560 doi:10.1186/1471-2164-11-560. E. Meglécz, C. Costedoat, V. Dubut, A. Gilles, T. Malausa, N. Pech & J-F. Martin. 2010. QDD: a user-friendly program to select microsatellite markers and design primers from large sequencing projects. Bioinformatics. 26,3: 403-404. M. Hassouna, C. Massiani, Y. Dudal, N. Pech & F. Theraulaz. 2010. Changes in water extractable organic matter (WEOM) in a calcareous soil under field conditions with time and soil depth. Geoderma. 155: 75-85. E. Corse, C. Costedoat, R. Chappaz, N. Pech, J-F. Martin & A. Gilles. 2010. A PCR-based method for diet analysis in freshwater organisms using 18S rDNA barcoding on faece. Molecular Ecology Resources. 10: 96-108. DOI: 10.1111/j.1755-0998.2009.02795.x 2009 E. Corse, C. Costedoat, N. Pech, R. Chappaz, J. Grey & A. Gilles. 2009. Trade-off between morphological convergence and opportunistic diet behavior in fish hybrid zone Frontiers in Zoology, 6:26doi:10.1186/1742-9994-6-26 V. Dubut, P. Murail, N. Pech, MD Thionville & F. Cartault. 2009. Phylogeography, and inter/extra-Indian admixture on Reunion Island: a view from the mitochondrial DNA. Annals of human genetics. 73: 314-334.
Activités
Colloques: M. Mendoza-Vera, S. Kâ, S., M. Bouvy, C. Cuoc, X. Moreau, M. Pagano, N. Pech. 2010. Impact of cyanobacteria on zooplankton in the Senegal River Hydrosystem. 14th International Conference on Harmful Algae. 1-5 november 2010. Hersonissos. Grèce. C. Costedoat, C.F. Bilog Bilong, K. Elmer, A. Gilles, A. Meyer, S. Morand, A. Nyom Bitja, A. Pariselle, N. Pech (alphabetical order). 2009. Cryptic species in Western and Central Africa cichlids. European Society for Evolutionary Biology. 12th Congress, Turin, Italy, 24 -29 August 2009. E. Corse, C. Costedoat, N. Pech, R. Chappaz & A. Gilles. 2009. Les crottes passent à la caisse : développement d'un barcoding alimentaire adapté aux poissons de rivières. Rencontres de l'Ichtyologie en France (RIF 2009). Paris, 24-27 mars 2009. A. Marco A., T. Dutoit, C. Barthélemy, N. Pech, S. Lavergne, S. Oliveau & V. Bertaudière-Montes. 2009. Pertinence d'une approche combinée Sciences de la Nature et Sciences de l'Homme, pour prévoir et gérer les invasions d'espèces ornementales en région méditerranéenne. Conférence aux 2ème congrès le réveil du Dodo. Journées des Sciences de la Conservation de la Biodiversité. Montpellier 16-19 Mars 2009.