Organisation des semestres et Unités d’enseignement (UE)
Année 1 - Semestre 1
Tronc commun
TC1 - Traitement des données
Ce cours fournit aux étudiants différents outils mathématiques pour résoudre des problèmes environnementaux : outils mathématiques, statistiques et optimisation de plans d’expériences
TC2 - Les grands enjeux environnementaux
7 thèmes sont abordés tous les ans, et traités sous forme de cours, de conférences et de TD.
Changement climatique, La biodiversité menacée ?, Ressources énergétiques, Ressources enn eau, L’Homme et l’érosion, Déchets, Qualité de l’air
Unités d’enseignements obligatoires
B1a-I1a - Structure et fonctionnement des écosystèmes
(commun BioEco / Ingébio)
Connaissance approfondie sur la structure, les facteurs d’organisation et le fonctionnement des écosystèmes terrestres et aquatiques, en se focalisant sur les écosystèmes méditerranéens
B1b-I1b - Techniques d’analyses multivariées en écologie
(commun BioEco / Ingébio)
Autonomie du jeune chercheur sur le plan du traitement statistique de ses données de terrain ou/et de laboratoire
B2a - Le sol vivant
Bases fondamentales à la compréhension du fonctionnement biologique des sols et du rôle de ce milieu vivant dans la dynamique des écosystèmes
B2b - Bases génétiques de la biodiversité
Bases incontournables pour tout étudiant se destinant à un M2 traitant de la biologie évolutive et de la biodiversité. La biodiversité est le produit de l'évolution. Sa conservation et son exploitation raisonnée par les biotechnologies, se doivent d'assurer le maintien des processus évolutifs. L’enseignement se focalisera sur les processus mis en jeu au niveau des populations affectant la variation des traits discrets et quantitatifs
Unités d’enseignements optionnelles (1 UE à choisir parmi les 3)
B3a - Paléoenvironnement et biogéographie évolutive
Changements environnementaux et écologiques sous l'effet du climat et de l'action humaine durant le Cénozoïque. Bilan de l’histoire des écosystèmes au cours du quaternaire et des techniques d’étude des paléoenvironnements
B3b-I3b - Physiologie microbienne
(commun BioEco/Ingébio)
Amener les étudiants à une compréhension approfondie de la physiologie des microorganismes. Présentation des acquisitions scientifiques récentes dans les domaines du métabolisme secondaire. Cette UE constitue un indispensable préliminaire à la compréhension d’autres UE faisant intervenir des microorganismes
B3c-I3c - Biologie fonctionnelle et biologie du développement chez les végétaux
(commun BioEco/Ingébio)
Les avancées en génomique fonctionnelle végétale ont contribué à l’émergence de nouvelles disciplines scientifiques associant des problématiques d’écologie, de biologie du développement et d’écologie évolutive. Présentation des acquisitions scientifiques récentes
Année 1 - Semestre 2
Tronc commun
TC3 - Projet tutoré de première année
A partir d’études bibliographiques et d’expériences de terrain et de laboratoire, en relation avec l’expertise de la spécialité, les étudiants devront construire et rédiger un mémoire de recherche et exposer une communication scientifique. Le travail est à faire en groupe
En savoir plusTC4 - Langues / communication
Apprentissage de l’Anglais scientifique et des affaires.
Acquisition de bases solides en Communication, pour mener à bien une recherche de stage et d’emploi en utilisant des techniques modernes de type « media-training ». Conduite de débats contradictoires, gestion de conflits d’usage entre administrations, associations et/ou particuliers
Ecologie adaptative et écophysiologie (1 UE à choisir parmi les 3)
B4a - Ecologie adaptative et écophysiologie animale
Compréhension approfondie des mécanismes adaptatifs aux contraintes de l’environnement depuis le comportement jusqu’aux adaptations physiologiques chez les animaux
B4b - Ecologie adaptative et écophysiologie végétale
Compréhension approfondie des mécanismes adaptatifs aux contraintes de l’environnement, stratégies adaptatives, trade-off, notion de trait biologique, gestion de l’équilibre hydrominéral, stratégies photosynthétiques
B4c - Ecologie adaptative et écophysiologie microbienne
Compréhension approfondie du rôle écologique et de l’écophysiologie des microorganismes et en particulier des microorganismes du sol
Méthodologie (2 UE à choisir parmi les 4) (commun BioEco / Ingébio)
B5a-I5a - Méthodes en écologie végétale
Maîtrise des différentes méthodes et techniques d’échantillonnage et de quantification des populations et communautés végétales
B5b-I5b - Méthodes en écologie animale
Maîtrise des différentes méthodes et techniques d’échantillonnage et de quantification des populations et communautés animales
B5c-I5c - Méthodes d’analyse physico-chimique des sols
Acquisition des méthodes et techniques utilisées dans l’analyse des propriétés physico-chimiques et biologiques des sols
B5d-I5d - Méthodes d’analyse en écologie moléculaire
Recherche d’une bonne adéquation des outils analytiques à la problématique scientifique. Analyses spatiales 1D et 2D, de clustering, de variances moléculaire (AMOVA). Analyse phylogéographique ((Nested Clade Analysis). Développements récents de la génomique écologique
Spécialisation (2 UE à choisir parmi les 6) (commun BioEco / Ingébio, sauf B6f)
B6a-I6a - Ecologie du paysage
La notion de paysage, structure, fonctionnement. Rôle fonctionnel et dynamique des paysages. Hétérogénéité, analyse spatiale, rôle des perturbations. Interaction entre écosystèmes. Rôle de l’homme dans la création et la dynamique du paysage. Notion de paysage dans les hydrosystèmes, bassins versants. Méthodes d’analyses spatiales
B6b-I6b - Ecologie des milieux de montagne
Spécificité et fonctionnement des écosystèmes alpins. Etagement altitudinal dynamique des espèces et des populations, histoire de l’anthropisation, paysages. Risques et perturbations. Les milieux aquatiques et humides (tourbières, lacs, torrents) : particularités, fonctionnement, biodiversité
B6c-I6c - Ecologie des milieux méditerranéens
Biodiversité de l’aire Méditerranéenne, évolution et dynamique des écosystèmes méditerranéens, aspects bioclimatiques, végétation et agro-écologie méditerranéennes, particularités des milieux aquatiques Méditerranéens
B6d-I6d - Ecologie des arthropodes terrestres et aquatiques
Acquisition des connaissances systématiques et écologiques pour l'analyse des communautés d'arthropodes terrestres et aquatiques. Module destiné aux étudiants ayant eu une formation plutôt botanique auparavant et qui désirent compléter leurs connaissances sur la faune invertébrée
B6e-I6e - Ecologie forestière et dendroécologie
Structure des écosystèmes forestiers. Analyse spatiale. Naturalité et biodiversité. Dynamique et structure des peuplements en réponse aux incendies et autres perturbations. Biologie de l’arbre. Dendrochronologie. Rôle du climat et impact des changements climatiques. Critères de reconnaissances macroscopiques et microscopiques des principales essences forestières
B6f - Ecologie des eaux continentales
Hiérarchie et échelles en écologie des eaux continentales : du bassin versant aux microhabitats. Concepts de la limnologie (River Continuum Concept, Flood Pulse Concept, Nutrient spiraling)
De nombreux modules sont mutualisés avec la spécialité professionnelle INGEBIO, offrant une passerelle implicite entre les deux spécialités à la fin de la première année.
