Le cours d'analyse spectrale de J. Guiot 
Un séminaire traitement de données intitulé "SE-Min-R" est organisé en décembre 2004.
Bases de données / Analyses multivariées / Modélisation / Graphisme
Salle de cours du SESAO - (Aile 2 niveau 6 à St Jérôme)A. Baumel - J. Le Cuziat - F. Torre
Dernière mise à jour : lundi 10 janvier
Documents, Liens, Données... (accès réservé)
Contenu du séminaire (fichier PDF)
Les 4 groupes d'inscrits (mise à jour 29/11)
Inscriptions/rectifications: franck.torre@univ.u-3mrs.fr Inscriptions:
Cours - mercredi 1er décembre - 14h-17h (Amphi Cartan)
20' - Introduction à R: (Franck)
Historique, intérêt, présentation de l'environnement et des packages, liste et description des packages intéressants dans le cas des problématiques abordées par les équipes de l'IMEP.
40' - Application 1: (Alex)
Analyse de données multivariées morphométriques chez Armeria (ACP, cluster), Analyse de données génétiques (ANOVA, F test)
40' - Application 2: (Joseph)
Analyse de relevés de végétation, classification images sat pour cartographie (CHA, CART, SIG)
Analyse de patrons de distribution spatiale de semis de points (Points patterns)
40' - Application 3: (Franck)
Présentation du travail réalisé dans le cadre DEA de Ildiko S.
40' - Application 4:
A définir ...
Pour le cours, les applications doivent permettre d'illustrer les possibilités de traitement de données sous R. L'idée est de présenter des exemples d'études finalisées, de montrer comment sont manipulés les données sous R et de mettre en évidence les capacités de sorties graphiques et les interconnections possibles entre R et d'autres logiciels usuels (Access, Excel, SIG).
Travaux dirigés sur ordinateurs (salles du SESAO, St jérôme)
TDs groupe 1
Mardi 14 - matin 8h-11h ........... salle verte
mercredi 15 - matin 9h-12h ...... salle bleue
TDs groupe 2
Mardi 14 - après midi 13h-16h .......... salle verte
mercredi 15 - après midi 14h-17h ..... salle de cours
TDs groupe 3
Jeudi 16 matin 8h-11h et après midi 13h-16h ..... salle de cours
TDs groupe 4
Mercredi 15 de 8 à 10h (à confirmer)
Jeudi 16 matin 8h-11h et après midi 15h30-18h (à confirmer) ..... salle de cours
Grp 1 & 2 (2 x 3h00)
public : participants de l'IFRE - Les bases statistiques sont supposées acquises
=> Présentation et illustration de l'utilisation de l'environnement R
- Manipulation des données (import - export - types de variables)
- Utilisation des fonctions (packages - programmation)
- Création de graphiques
- Analyses multivariées (ACP, AFC, ACM) -> {toolboxes=ADE4}
- Analyses canoniques - couplages de tableaux (RDA, ACC) -> {ADE4}
- Classifications (CHA - Kmeans - CART) -> toolboxes=stats,cluster,tree, mvpart
- Statistique inférentielle (Tests - T student -> ANOVA -, Regressions,
- GLM, GAM) -> toolboxes = ctest, gmv
Grp 3 (2 x 3h00)
public : Etudiants M2 du Master Pro spécialité BIOSE – parcours BE
(Rappel des bases statistiques au cours du TD )
=> Présentation de méthodes statistiques usuelles et de leur implémentation sous R
- tests statistiques (Comparaison de moyennes - appariées / non appariées / paramétrique / non-paramétrique -, Chi² ...) – utilisation 1/ des fonctions Excel et 2/ de R
- Import de données
- Analyses multivariées : l'Analyse en Composantes Principales (ACP)
Le cours d'analyse spectrale de J. Guiot